"L'unité d'intervention musclée « Shell Squad », dirigée par le cyborg intégral Motoko Kusanagi."
2029, un Japon du futur proche. Le cyborg Motoko Kusanagi envisage une unité de lutte contre les menaces émergentes. Daisuke Aramaki recrute son équipe et forme la Section 9 de la Sécurité publique, alias l'« Unité spéciale ». Un complot se dessine et un hacker émerge : le « Marionnettiste ». Que réserve l'avenir à Kusanagi ? Que veut ce hacker ? Une nouvelle ère d'action cyberpunk commence !